Olá Gustavo,
Como você está exportando o arquivo?
O importador de vocabulário aceita apenas arquivos CSV. Sabemos que o Excel adiciona algumas outras informações no arquivo quando salvamos. E isso pode gerar alguns problemas. Eu sugiro que você tente exportar o arquivo para o formato CSV a partir do Libre Office Calc ou Google Planihas.
Aqui neste tópico Tesauro de Objetos do Patrimônio Cultural nos Museus Brasileiros - #4 por rpeccini eu anexei um arquivo CSV de um tesauro que já importei para o Tainacan. Veja se você consegue subir o primeiro. O segundo é para importação de itens, apenas.